עמותות אותות פועלת במסגרת ארצית, היא מנהלת ומפעילה מסגרות חוץ ביתיות ברחבי הארץ.
העמותה פועלת בשיתוף ובפיקוח של משרד הרווחה והשירותים החברתיים, במסגרת רשות חסות הנוער.
לעמותה יש מסגרות קצרות מועד (מחוסרי קורת גג וחלופת מעצר) ומסגרות ארוכות טווח עם התמחויות שונות.